对全球而言，新冠疫情暴发是一场灾难，严重危害了人类的健康。截至2021年10月26日，全球已确诊2.34亿人，死亡人数为494.8万人。在与此次疫情的抗击中，核酸检测技术功不可没。

徐英春教授指出，新冠病毒基因测序是非常重要的一项工作。我们能够快速发现新型冠状病毒（SARS-COV-2）得益于新一代测序技术（NGS，也称为第二代测序技术）。NGS是对传统测序技术的革命性变革，它的出现使得对一个物种的转录组和基因组进行细致全貌的分析成为可能。2014年《新英格兰医学杂志》刊登了一例mNGS技术成功用于脑膜炎感染病原学诊断的病例，这开启了感染性疾病精准诊疗的新纪元。

NGS也有利于病原体的分型及溯源。病原体分型及溯源的意义主要有助于暴发的识别与调查；监控每种病原体的变化趋势（时间变化及特定人群）；有助于有目的地制定病原体控制政策及措施；能够提供病例信息以确定控制措施的有效性。

通过这次新冠疫情，可以看到我国新发突发传染病应急能力有较大的提高。梳理新冠疫情暴发以来的时间线可以发现，在不明原因肺炎出现1个多月的时间内，国内研究团队就迅速锁定了致病原，完成了毒株分离、基因破译、试剂研发。

疫情暴发初期，没有合适的诊断试剂盒，协和医院首先进行了临床实验室自建方法（LDT），包括n基因+e基因和n基因+f基因两条路线，一份标本在检验科和感染科同时进行检测，看结果是否可靠，从而优化LDT，为进一步制作SARS-COV-2诊断试剂盒提供了十分重要的信息。

核酸检测技术也在逐步发展。聚合酶链式反应（PCR）用于病原体定性，检测下限为10³；荧光定量PCR相对定量检测，检测下限为10²；微滴式数字PCR为绝对定量检测，检测下限为10¹，能够实现低病毒载量样本的精准检测。

多重实时荧光PCR快检设备操作简便，可进行多重检测；环介导等温扩增反应（LAMP）灵敏度高、反应时间短（表1），临床使用不需要特殊的仪器且结果判断形式多样化（肉眼检测和荧光检测），更容易被基层医院接受；实时荧光核酸恒温扩增检测技术扩增效率高、反应时间短、反应条件简单及操作简便的优点，灵敏度不低，可应用的场景较多（例如疑似新冠患者或者确诊患者的密切接触者）；多重巢式PCR可集样品制备、扩张、检测和分析功能于一体，特别适合症候群病原体检测（例如新冠患者同时感染其他呼吸道道病原体的情况）；碟式芯片是集核酸提取技术+等温扩增+微流控芯片+共焦荧光实时检测技术，可一次性检测19种呼吸道常见病原体。这些技术的提升都在提高我们对病原体的诊断能力。

表1 多种核酸检测技术

北京协和医院在武汉中法新城院区的重症监护病房中发现约70%患者出现肢端缺血，脑梗死发生率为10.1%，终末期患者亦少见失代偿DIC相关出血，同时纤维蛋白原和D二聚体显著升高，那么重症COVID-19患者出现高凝状态的原因是什么呢？

表2 重症COVID-19患者具有多种类高滴度抗磷脂抗体

重症COVID-19患者具有多种类、高滴度抗磷脂抗体（表2），同时临床发生了血栓事件，尸检（图1）可见肾小球、肝血窦及肺血管微血栓。因此，重症COVID-19患者是继发性抗磷脂抗体综合征。

图1患者尸检结果

通过实验室结果和病理结果的证实，我们认识了重症COVID-19的临床表现。

1. 重症COVID-19患者在疾病后期易产生抗磷脂抗体，这与广泛内皮损伤、血小板激活相关。

2. 抗磷脂抗体谱抗体阳性率47%，多个亚型的抗磷脂抗体呈现动态变化：IgA型抗磷脂抗体为主通常为广泛呼吸道、胃肠道黏膜细胞损伤；一过性、单项、低滴度抗磷脂抗体为自身免疫应答/紊乱现象；持续性、多项、高滴度抗磷脂抗体与血栓事件密切相关。

3. 临床应重视COVID-19继发性抗磷脂抗体综合征的风险。

我国的预警、预防能力也在提升。国家微生物科学数据中心建立全球首个SARS-COV-2基因组已知变异及虚拟变异进行多维度风险评估和预警系统，这对我们今后控制常态化防控新冠疫情提供了便利。

同时，我国的疫苗研发速度也大大提升。目前覆盖了灭活疫苗、腺病毒载体疫苗、减毒流感病毒载体疫苗、重组蛋白疫苗、核酸疫苗5条技术路线，两种灭活疫苗已经得到了世界卫生组织的认可。

2002年飞行时间质谱技术获得诺贝尔化学奖，评奖委员会认为该技术突破了生物大分子质谱分析的难题，在临床诊断领域具有巨大的应用潜力。2013年美国FDA批准了基质辅助激光解析电离飞行时间质谱（MALDI-TOF MS ）仪器用于临床微生物检测。MALDI-TOF MS  质谱技术被誉为“微生物检验的革命”。截至2021年9月，在我国获得国家药品监督管理局注册证的MALDI-TOF MS 产品共有14家，其中国产12家，我国的相关技术也在飞速发展。

2014年的一例病例在培养基中培养出了该血流感染患者的病原体，利用MALDI-TOF MS 质谱鉴定该病原体为橡树念珠菌，这是首次发现该病原体能引起人类菌血症。这表明新老技术的结合可提高发现新病原体的能力。

真菌快速智能综合识别技术对关键真菌特征标注（孢子大小、形状、均是分个、颜色等），通过计算机批量训练、学习、识别，实现“以图搜图”，进行现场真菌图片的快速检索识别。提高我们对真菌的诊断能力。

徐英春教授表示，技术的发展提高了我们认识病原体、诊断病原体的能力，也让感染性疾病的诊治迈向了新台阶。

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