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近日，《柳叶刀》（The Lancet）杂志发表一项针对南非SARS-CoV-2奥密克戎变异株临床严重程度的早期评估。研究提示，与同期诊断的非基因靶标失效（SGTF）感染者相比，SGTF感染者的住院率显著降低；与早期感染德尔塔变异株的个体相比，SGTF感染者发展成重症的概率明显降低；重症概率的降低可能部分由于既往免疫。
背景
2021年11月，南非出现SARS-CoV-2奥密克戎（omicron）关切变异株（variant of concern），这与COVID-19病例数的增加有关。本研究以Thermo Fisher Scientific TaqPath COVID-19 PCR检测中的S基因靶标失效（SGTF）作为指标，评估omicron变异株感染的临床严重程度。
方法
本研究把南非国家的COVID-19病例数据、SARS-CoV-2实验室检测数据、SARS-CoV-2基因组数据，以及COVID-19病例住院数据进行了数据关联。对于经TaqPath PCR检测诊断为感染COVID-19的个体，感染类型分为SGTF和非SGTF。并通过基因组测序检测德尔塔（delta）变异株。使用多元逻辑回归模型，通过比较2021年10月1日至11月30日期间诊断为SGTF与非SGTF感染的个体，评估疾病严重程度和住院情况；通过比较2021年10月1日至11月30日期间诊断为SGTF感染的个体与2021年4月1日至11月9日期间诊断为delta变异株感染的个体，进一步评估疾病严重程度。
结果
2021年10月1日（第39周）至2021年12月6日（第49周）期间，南非共报告161,328例COVID-19病例。38,282人通过TaqPath PCR检测被确诊，其中29,721例为SGTF感染和1,412例为非SGTF感染。SGTF感染比例从第39周的2人/63人（3.2%）增加到第48周的21,978人/22,455人（97.9%）。控制住院相关因素后，SGTF感染者的住院率显著低于非SGTF感染者(256人/10,547人,2.4% vs 121人/948人,12.8%; 调整比值比[aOR]为0.2, 95% CI 0.1–0.3）。控制疾病严重性相关因素后，SGTF与非SGTF感染的住院患者重症率相近（42人/204人,21% vs 45人/113人，40%；调整比值比[aOR]为0.7，95% CI为0.3~1.4。控制疾病严重性相关因素后，与早期德尔塔变异株的感染者相比，SGTF感染者的重症概率显著降低（496人/793人，62.5% vs 57/244人，23.4%；调整比值比[aOR]为0.3，95% CI为0.2~0.5）。
该研究早期分析提示，与同期诊断的非SGTF感染者相比，SGTF感染者的住院率显著降低。与早期感染德尔塔变异株的个体相比，SGTF感染者发展成重症的概率明显降低。重症概率的降低可能部分由于既往免疫。END
本文转发自柳叶刀TheLancet
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